MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578 plasmid pKPN3

Total Repeats: 3553

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009649	TGT	2	6	92	97	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152973417
2	NC_009649	GGC	2	6	98	103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973417
3	NC_009649	AGA	2	6	356	361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009649	CATG	2	8	430	437	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009649	T	6	6	635	640	0 %	100 %	0 %	0 %	152973418
6	NC_009649	CCA	2	6	651	656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152973418
7	NC_009649	TTC	2	6	659	664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973418
8	NC_009649	TCA	2	6	693	698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973418
9	NC_009649	CAG	2	6	705	710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973418
10	NC_009649	CGT	2	6	823	828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973418
11	NC_009649	TCA	2	6	849	854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973418
12	NC_009649	GAC	2	6	947	952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973418
13	NC_009649	CAT	2	6	971	976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973418
14	NC_009649	TTC	2	6	986	991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973418
15	NC_009649	CTGA	2	8	1040	1047	25 %	25 %	25 %	25 %	152973418
16	NC_009649	CT	3	6	1117	1122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009649	T	6	6	1122	1127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009649	T	8	8	1185	1192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009649	TGA	2	6	1198	1203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009649	CTG	2	6	1229	1234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_009649	TGAA	2	8	1246	1253	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009649	AATA	2	8	1254	1261	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009649	AGC	2	6	1307	1312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009649	TA	3	6	1325	1330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009649	TAA	2	6	1372	1377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009649	A	8	8	1441	1448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009649	AAG	2	6	1452	1457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009649	TG	3	6	1462	1467	0 %	50 %	50 %	0 %	152973419
29	NC_009649	TGG	2	6	1470	1475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973419
30	NC_009649	TGG	2	6	1560	1565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973419
31	NC_009649	TGG	2	6	1614	1619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973419
32	NC_009649	CAA	2	6	1673	1678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152973419
33	NC_009649	TTC	2	6	1707	1712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973419
34	NC_009649	ATC	2	6	1803	1808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973419
35	NC_009649	TAA	2	6	1818	1823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973419
36	NC_009649	TAC	2	6	1830	1835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973419
37	NC_009649	AGCA	2	8	1910	1917	50 %	0 %	25 %	25 %	152973419
38	NC_009649	CAG	2	6	1949	1954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973419
39	NC_009649	CCG	2	6	1961	1966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973419
40	NC_009649	CTG	2	6	1967	1972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973419
41	NC_009649	CTG	2	6	1997	2002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973419
42	NC_009649	GCT	2	6	2005	2010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973419
43	NC_009649	TAA	2	6	2043	2048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973419
44	NC_009649	CTG	2	6	2063	2068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973419
45	NC_009649	GAA	2	6	2115	2120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152973419
46	NC_009649	A	6	6	2170	2175	100 %	0 %	0 %	0 %	152973419
47	NC_009649	GCA	2	6	2187	2192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973419
48	NC_009649	ATA	2	6	2216	2221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973419
49	NC_009649	ATG	2	6	2339	2344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973419
50	NC_009649	TGC	2	6	2361	2366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973419
51	NC_009649	TGC	2	6	2433	2438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973419
52	NC_009649	GCC	2	6	2488	2493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973419
53	NC_009649	GCT	2	6	2494	2499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973419
54	NC_009649	AGG	2	6	2513	2518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152973419
55	NC_009649	AGC	3	9	2523	2531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973419
56	NC_009649	CGC	2	6	2532	2537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973419
57	NC_009649	A	8	8	2546	2553	100 %	0 %	0 %	0 %	152973419
58	NC_009649	GCA	2	6	2566	2571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973419
59	NC_009649	GAG	2	6	2584	2589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152973419
60	NC_009649	AAAAGC	2	12	2607	2618	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	152973419
61	NC_009649	TGC	2	6	2763	2768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973419
62	NC_009649	TCA	2	6	2786	2791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973419
63	NC_009649	TGG	2	6	2822	2827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973419
64	NC_009649	GAT	2	6	2919	2924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973419
65	NC_009649	AGC	2	6	2970	2975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973419
66	NC_009649	ATGA	2	8	3022	3029	50 %	25 %	25 %	0 %	152973419
67	NC_009649	ATT	2	6	3331	3336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152973419
68	NC_009649	G	8	8	3450	3457	0 %	0 %	100 %	0 %	152973419
69	NC_009649	TTCC	2	8	3482	3489	0 %	50 %	0 %	50 %	152973419
70	NC_009649	TTC	2	6	3534	3539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973419
71	NC_009649	AAGC	2	8	3582	3589	50 %	0 %	25 %	25 %	152973419
72	NC_009649	AGG	2	6	3708	3713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152973419
73	NC_009649	AAAAT	2	10	3780	3789	80 %	20 %	0 %	0 %	152973419
74	NC_009649	TAA	2	6	3796	3801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973420
75	NC_009649	GAA	3	9	3818	3826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152973420
76	NC_009649	GCT	2	6	3854	3859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973420
77	NC_009649	GAT	2	6	3884	3889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973420
78	NC_009649	TATT	2	8	3892	3899	25 %	75 %	0 %	0 %	152973420
79	NC_009649	CTG	2	6	3924	3929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973420
80	NC_009649	TTC	2	6	3967	3972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973420
81	NC_009649	GCT	2	6	4010	4015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973420
82	NC_009649	TGA	2	6	4064	4069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973420
83	NC_009649	GAA	2	6	4096	4101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009649	ATT	2	6	4118	4123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009649	T	6	6	4122	4127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009649	ATG	2	6	4148	4153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009649	CGT	2	6	4244	4249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009649	A	7	7	4329	4335	100 %	0 %	0 %	0 %	152973421
89	NC_009649	TGT	2	6	4356	4361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152973421
90	NC_009649	TG	3	6	4387	4392	0 %	50 %	50 %	0 %	152973421
91	NC_009649	GCC	2	6	4413	4418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973421
92	NC_009649	GGAA	2	8	4442	4449	50 %	0 %	50 %	0 %	152973421
93	NC_009649	GCA	2	6	4487	4492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973421
94	NC_009649	GCG	2	6	4559	4564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973421
95	NC_009649	CTGGA	2	10	4587	4596	20 %	20 %	40 %	20 %	152973421
96	NC_009649	GCAA	2	8	4609	4616	50 %	0 %	25 %	25 %	152973421
97	NC_009649	GGC	2	6	4631	4636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973421
98	NC_009649	TCT	2	6	4643	4648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973421
99	NC_009649	TCA	2	6	4708	4713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973421
100	NC_009649	CGC	2	6	4760	4765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973421
101	NC_009649	GAT	2	6	4803	4808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973421
102	NC_009649	GCA	2	6	4832	4837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973421
103	NC_009649	TTA	2	6	4880	4885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152973421
104	NC_009649	CTC	2	6	4889	4894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_009649	TTAC	2	8	4921	4928	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_009649	TATCT	2	10	4964	4973	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_009649	CTA	2	6	5020	5025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_009649	CT	3	6	5031	5036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_009649	AAGT	2	8	5122	5129	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009649	GTA	2	6	5157	5162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009649	TCC	2	6	5163	5168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_009649	CAG	2	6	5217	5222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973422
113	NC_009649	TGC	2	6	5299	5304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973422
114	NC_009649	AAG	2	6	5331	5336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152973422
115	NC_009649	TGA	2	6	5370	5375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973422
116	NC_009649	GAA	2	6	5390	5395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152973422
117	NC_009649	CTC	2	6	5426	5431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152973422
118	NC_009649	TTG	2	6	5509	5514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009649	AAT	2	6	5523	5528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009649	TGA	2	6	5569	5574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009649	TCT	2	6	5614	5619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_009649	GGAA	2	8	5631	5638	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009649	CGC	2	6	5830	5835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973423
124	NC_009649	GTCA	2	8	6107	6114	25 %	25 %	25 %	25 %	152973423
125	NC_009649	TCA	2	6	6157	6162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973423
126	NC_009649	CCGA	2	8	6204	6211	25 %	0 %	25 %	50 %	152973423
127	NC_009649	TGG	2	6	6265	6270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973423
128	NC_009649	CG	3	6	6272	6277	0 %	0 %	50 %	50 %	152973423
129	NC_009649	CGG	2	6	6438	6443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973423
130	NC_009649	CG	3	6	6475	6480	0 %	0 %	50 %	50 %	152973423
131	NC_009649	AAG	2	6	6532	6537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152973423
132	NC_009649	TGC	2	6	6577	6582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973423
133	NC_009649	CG	3	6	6586	6591	0 %	0 %	50 %	50 %	152973423
134	NC_009649	AAC	2	6	6594	6599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152973423
135	NC_009649	TTCC	2	8	6632	6639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_009649	A	6	6	6642	6647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009649	CCGG	2	8	6649	6656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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399	NC_009649	TCA	2	6	19587	19592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973429
400	NC_009649	AAC	2	6	19612	19617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152973429
401	NC_009649	CGG	2	6	19643	19648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973429
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403	NC_009649	ACG	2	6	19937	19942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973429
404	NC_009649	ACG	2	6	19950	19955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973429
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406	NC_009649	TGAG	2	8	20070	20077	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_009649	TCA	2	6	21484	21489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
435	NC_009649	ATTT	2	8	21607	21614	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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437	NC_009649	CCCA	2	8	21710	21717	25 %	0 %	0 %	75 %	152973431
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452	NC_009649	TCTG	2	8	22709	22716	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
453	NC_009649	AAT	2	6	22799	22804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_009649	CT	3	6	22822	22827	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
455	NC_009649	TTG	2	6	22895	22900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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457	NC_009649	CTCC	2	8	23007	23014	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
458	NC_009649	CAT	2	6	23056	23061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973432
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461	NC_009649	CAA	2	6	23199	23204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152973432
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483	NC_009649	TGA	2	6	24121	24126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
484	NC_009649	TCA	2	6	24202	24207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
485	NC_009649	CAAG	2	8	24264	24271	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
486	NC_009649	GTC	2	6	24279	24284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
487	NC_009649	CAT	2	6	24355	24360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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489	NC_009649	TC	3	6	24634	24639	0 %	50 %	0 %	50 %	152973433
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497	NC_009649	CCA	2	6	24909	24914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152973433
498	NC_009649	AGGCC	2	10	24949	24958	20 %	0 %	40 %	40 %	152973433
499	NC_009649	TAT	2	6	24968	24973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152973433
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